Genetic Lab
RO Shop
Secvențierea exomului și a genomului (WES/WGS): când trimiți pacientul la genetică
Genetica

Secvențierea exomului și a genomului (WES/WGS): când trimiți pacientul la genetică

Dr. Alexandru Calotă-Dobrescu 6 min read

Secvențierea întregului exom (WES) și a întregului genom (WGS) au trecut din cercetare în practica clinică curentă. Genetic Lab oferă consult genetic și aceste analize, cu interpretare pe panel virtual adaptat întrebării clinice. Articolul rezumă când merită trimis un pacient, ce nu putem acoperi și ce informații fac trimiterea mai utilă.

Când merită trimis un pacient

Pediatrie și boli rare

Indicațiile includ anomaliile congenitale, întârzierea în dezvoltare, dizabilitatea intelectuală, dismorfismul, epilepsia fără etiologie stabilită, hipoacuzia congenitală, hipotonia și statura mică neexplicată.

Ghidul bazat pe dovezi al ACMG (2021) formulează o recomandare puternică pentru WES sau WGS ca test de primă sau a doua linie în această populație. Argumentele sunt utilitatea clinică demonstrată asupra managementului activ și pe termen lung, valoarea pentru planificarea reproductivă a familiei și dovezile limitate de efecte negative.

Ordinele de mărime, utile în discuția cu familia:

ComparațieRezultatSursă
WGS vs. testare standard38% vs. 21% (RR 1,76)Ontario HTA, în ghidul ACMG 2021
WES vs. microarray37% vs. 19%Meta-analiză 2025, 102 studii
WES, interval raportat28–43%AAP, raport clinic 2025
WGS față de WEScu 10–20% mai multAAP, raport clinic 2025

Oncogenetică

Criteriile NCCN includ debutul la vârstă tânără, agregarea pe aceeași ramură familială, cancerele primare multiple la același pacient, cancerul ovarian sau pancreatic la orice vârstă, cancerul de sân la bărbat, asocierile sân–ovar sau colon–endometru și o variantă deja identificată la o rudă.

Cardiogenetică

Se pot trimite pacienții cu cardiomiopatii, canalopatii, aortopatii cu debut precoce sau hipercolesterolemie familială, precum și cei cu eveniment aritmic sau moarte subită la o rudă tânără.

Alte situații

  • Pacientul fără diagnostic, după o evaluare fenotipică rezonabilă și investigații neconcludente.
  • Testarea în cascadă, când o variantă patogenă este cunoscută în familie.

Ce nu acoperim

Diagnosticul prenatal pe probe fetale. Timpul de răspuns al analizelor noastre nu este compatibil cu deciziile dintr-o sarcină în evoluție. Putem prelua consilierea preconcepțională și evaluarea cuplului pe probe postnatale. Pacientele însărcinate care necesită testare pe lichid amniotic sau vilozități coriale trebuie orientate către un serviciu de diagnostic prenatal.

Mecanisme nedetectabile prin secvențiere: expansiunile de secvențe repetitive, defectele de metilare și imprinting, rearanjamentele echilibrate și mozaicismul de nivel scăzut. În aceste situații vă comunicăm care este investigația corectă.


Ce informații fac trimiterea mai utilă

  • Fenotipul, cât mai specific. „Întârziere în dezvoltare” orientează mult mai puțin decât enumerarea semnelor: tipul întârzierii, semne neurologice, dismorfism, malformații asociate, traseu evolutiv, parametri de creștere. Termenii HPO sunt un avantaj, fiind limbajul algoritmilor de prioritizare a variantelor.
  • Investigațiile deja efectuate, inclusiv cele normale. Un RMN sau un profil metabolic normal restrâng semnificativ căutarea.
  • Istoricul familial, chiar sumar: consanguinitate, alți membri afectați, pierderi de sarcină repetate, decese neexplicate la vârstă tânără. Ideal, pe trei generații.
  • Ipoteza clinică, chiar dacă este nesigură. O suspiciune formulată este mai utilă decât o trimitere neutră.
  • Întrebarea concretă: confirmarea unui diagnostic, orientarea unui tratament, riscul de recurență sau evaluarea rudelor.

Cum lucrăm

  • Analiza trio. La pacienții pediatrici solicităm de regulă probe de la ambii părinți. Comparația permite stabilirea statusului de novo versus moștenit, crește randamentul diagnostic și reduce substanțial numărul variantelor de semnificație incertă.
  • Panel virtual, apoi extindere. Interpretarea pornește de la genele relevante pentru indicația clinică. Dacă analiza este neconcludentă, se extinde la restul datelor, fără o nouă prelevare.
  • Reanaliză. Datele rămân disponibile pentru reinterpretare pe măsură ce apar gene și dovezi noi, fără recoltare suplimentară. Pentru pacienții nediagnosticați, aceasta este de obicei următoarea etapă rezonabilă.
  • Standarde. Validarea și raportarea urmează ghidurile EuroGentest/ESHG pentru secvențierea diagnostică.
  • Rezultate secundare. La cererea pacientului raportăm variantele patogene și probabil patogene din lista ACMG SF, în versiunea în vigoare. Opțiunea este discutată și consemnată înainte de prelevare. La minori nu raportăm afecțiuni cu debut la vârsta adultă, cu excepția celor cu măsuri utile în copilărie.

Ce primiți înapoi

Primiți interpretarea clinică a rezultatului, nu doar lista de variante: corelația cu tabloul descris de dumneavoastră, semnificația variantelor identificate, recomandările de urmărire și indicația privind testarea rudelor. Pacientul beneficiază de o consultație de comunicare a rezultatului și primește scrisoare medicală.

Programează o Consultație Genetică

Surse

  1. Manickam K. et al. Exome and genome sequencing for pediatric patients with congenital anomalies or intellectual disability: an evidence-based clinical guideline of the ACMG. Genet Med. 2021. PubMed
  2. Malinowski J. et al. Systematic evidence-based review: outcomes from exome and genome sequencing for pediatric patients with congenital anomalies or intellectual disability. Genet Med. 2020. DOI
  3. Rodan L.H. et al. Genetic Evaluation of the Child With Intellectual Disability or Global Developmental Delay: Clinical Report. Pediatrics. 2025. AAP
  4. Diagnostic and clinical utility of exome sequencing and chromosomal microarray in children with GDD/ID: a meta-analysis. Annals of Medicine. 2025. Taylor & Francis
  5. Matthijs G. et al. Guidelines for diagnostic next-generation sequencing. EuroGentest / ESHG. Eur J Hum Genet. 2016. Nature
  6. Lee K. et al. ACMG SF v3.3 list for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2025. GIM
  7. Bennett R.L. et al. Standardized pedigree nomenclature: practice resource of the NSGC. J Genet Couns. 2022. Wiley
  8. NCCN. Genetic/Familial High-Risk Assessment: Breast, Ovarian, Pancreatic, and Prostate. NCCN

Informațiile din acest articol au caracter educativ și se adresează profesioniștilor din sănătate; nu înlocuiesc evaluarea clinică individuală.

Your Cart

Updating...
shopping_cart

Your cart is empty

View products
Subtotal
TVA
Discount ()
Total
Go to Checkout